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蔡元培来找林铄，说他手下爱国学社的十多名学生被租界巡捕房捉了去，请林铄设法疏通关系予以搭救。
林铄是通过张元济与蔡元培认识的，由于1902年南洋公学发生**，学生们因不满学校当局的管理，纷纷退学。作为学校老师的蔡元培站到了学生一边，带着退学学生离开了南洋公学，从而自己组建爱国学社。
由于经费困难，蔡元培就通过熟人四处去拉赞助，林铄就是这个时候认识了这位后来著名的学者和教育家。出于对这位“北大之父”的尊敬，林铄给了爱国学社很大的资助。
爱国学社由于学风zì yóu，加之从rì本回来的吴稚晖等人鼓动，渐渐成了国内第一个“革M团体”，这些人以《苏报》为根据地，不断地鼓吹“排满革命”，章太炎在《驳康有为论革M书》中公然骂光绪皇帝为“戴湉小丑，不辩稻粟”，鼓吹“非得革M，不可不革M”,而邹容在《革M军》中更是鼓动“杀尽满人方罢手”，从南洋陆师学堂退: 学的章士钊则在报上说革M就是“杀人主义”。
结果《苏报》被查禁，由于事先租界当局通风报信，《苏报》案主犯纷纷藏匿或是跑到rì本，最终只捉到了自投罗网的章太炎和邹容。清zhèng fǔ想把章太炎和邹容引渡受审，预判了两人“斩立决”，可是租界当局不准。
最终《苏报》案成了晚清史上颇为奇特又很有代表xìng的一个案件，这是以一国zhèng fǔ为原告，以本国国民为被告，由设在租界的中外联合审判机构“会审公廨”共同审理的特殊官司。
最终章太炎和邹容两人以诽谤罪被判处三年和两年监禁，经过长达十个月漫长的审判过程，国人从案件的审理中见识到了什么是言论zì yóu和思想zì yóu。
《苏报》案的审理还彻底的把满清朝廷的虚弱本质暴露无遗，章太炎和邹容两人一举成为人们心目中的“英雄”，自此，不管懂不懂得“革M”的人都以谈论“革M”荣，反正也不会杀头，套用鲁迅先生写的一句话就是“连阿Q都要和假洋鬼子争一争革M的资格”。
这起案件剥去了满清朝廷最后一块遮羞布。
蔡元培在《苏报》案后躲到了青岛，爱国学社被迫关闭，爱国学社的学生分成了四拨，一批进了林铄创办的上海商船学校，一批去了rì本留学，一部分人进了马相伯开办的震旦学院。其后由于天主教会想把震旦学院变成教会学校，学生们选择了退学，跟着马相伯重组复旦公学。对于这个后世著名的高校，林铄决不会放弃这个绝佳的沽名钓誉时机，由他提供场地和部分资金，复旦公学在杨树浦原来陈益如试种烟苗的农场开学，林铄和张謇成了复旦公学的主要出资人。
爱国学校剩下的最后一批人搬到了公共租界的余庆里，继续革M。
从rì本回来的“横滨暗杀团”成员杨笃生、苏鹏、何海樵等人也移师上海，与他们会合，他们要组建规模更大的“上海暗杀团”。
蔡元培在青岛躲了几个月后又回到了上海，这位清朝的瀚林现在成了个彻头彻尾的“革M者”，在他的鼓动下，原来爱国学社的张继、王小徐、孙毓筠、刘师培、章士钊、钟观光俞子夷等人都加入到暗杀团中，蔡元培还给暗杀团起了一个比较好听一点的名字――爱国协社，蔡元培成了暗杀团的领袖。
暗杀团成立，杨笃生、张继、何海樵、周来苏等人前往běi jīng，准备干一件惊天动地的大事――刺杀慈禧。
可惜，这帮人在běi jīng呆了半年，却连慈禧的影都没见着，西太后本就深居简出，即使出行，也是一大帮仪仗护卫，哪容得上闲杂人等凑到近前。眼见川资告罄，一行人只得打道回府，返回上海。
随后暗杀团又在江宁谋刺新任的军机大臣，正在江南巡视为北洋新军捞钱的铁良，也是无功而返。
这回，他们把目标对准了在上海租界当寓公的原广西巡抚王之chūn。
王之chūn在当时被称为头号卖国贼，他为了镇压广西民变，不惜引法军入桂，而且将广西的铁路路权和采矿权全都卖给了法国。王之chūn因国人的抗议而被朝廷免去了广西巡抚一职，但还不甘心。
《苏报》案的始作佣者也是这个王之chūn。
1904年11月19rì晚，位于上海闹市的金谷香蕃菜馆，象往常一样热闹、嘈杂，忽然一个衣着讲究的胖子在穿着青衫的仆从护拥下，从二楼匆忙跑下，抱头鼠窜。
一行人逃出了餐馆大门。
“狗贼，哪里跑！”突然，门前的路人间冲出一位壮汉，一把抓住了正在逃跑的胖子身上的马褂，右手的枪口顶住了胖子的脑袋。后边的随从傻了眼，那胖子双腿一软，似要跪地求饶。
“卖国贼，我现在代表四万万中国人对你执行枪决，去死吧！”壮汉一声高喊，随后扣动手中的枪机。
金谷香门前的路人吃惊地看着这一幕，有人认得那胖子，禁不住叫好：那不是王之chūn那个国贼吗？该杀……
咔！
枪声没响。
哑火了？开枪的好汉意识到出了点问题，抽回抓着王之chūn的左手拉动枪机，上膛之后，再扣，还没响！
已经闭上双眼等死的王之chūn终于醒悟过来，挣脱了那好汉的控制拼命向自己的马车跑去。“救命啊！”王之chūn钻到马车底下大声呼救。
王之chūn的手下也反应过来，一拥而上，把好汉按到了地上，那支破枪也被夺去。
大批印度巡捕闻讯而来，口中的哨子声响成一片。
好汉被巡捕们带到了巡捕房，巡捕带着王之chūn及其随从进到金谷香指认刺客的同伙，同来的暗杀团其他人混在人群中弃枪逃走。
刺杀虽然失败，但开启了革M党暗杀的先例：汉jiān国贼，人人得而诛之！
拿着那把破枪指着王之chūn的好汉叫万福华，一时成了人们称颂的英雄。
章士钊是自投罗网。
万福华被捕，他去到巡捕房探望，对于位于四马路上的公共租界总巡捕房，他倒也轻车熟路，当初《苏报》案时，他没少去探望在关在里面的章太炎和邹容。
但他根本没想到这次跟前次不一样。
《苏报》的时候，英国总巡捕认为爱国学社的反清演讲宣传是合法行为，公民的言论是应当受到保护的。当时巡捕房对这些革M党可以说是睁只眼闭只眼，你就是从他面前走过，也只当是没看见。
章士钊以为这次还和上次一样。
但这次真不一样。
万福华手拿凶器，持械杀人，这可是严重的刑事案件。
万福华是条好汉，声称刺杀王之chūn完全是出于个人义愤，对于王之chūn指认的同伙概不承认，余话绝不多说。
巡捕房正因万福华不开口，追查无门，但王之chūn指认还有同伙，正在发愁。
章士钊一大早就自动送上门来。
巡捕们立即扣押了章士钊，随便一问，章士钊随口就说出自己住在庆余里8号。
章士钊自己的住处藏着章太炎、邹容的《革M军》和刚刚印刷出来的陈天华所著《猛回头》、《jǐng世钟》等数千册，他有自己的苦衷，但却把暗杀团的总部说了出来。
捕头根据章士钊的回答,派华捕和红头阿三共五人,到馀庆里核查。
于是住在余庆里的暗杀团成员除杨笃生一人跑了出来，其余全部被捉，其中还包括刚从湖南跑出来的华兴会首脑黄兴。
好在租界当局和大清官员不怎么沟通，王之chūn虽然向上海道袁树勋检举这些被租界当局捉住的革M党，袁也曾向租界当局交涉过要引渡这些革M党受审。好在这些党人吸取了《苏报》一案的教训，大都用的是假名。
租界当局没有发现这些人犯有前科，所以袁树勋也没怎么放在心里。
逃出来的杨笃生去找蔡元培设法搭救同伙。